生信分析与组学挖掘
- WGS / RNA-seq / 单细胞数据分析
- ChIP-seq / RIP/CLIP-seq / MeRIP-seq
- 公共数据库挖掘与疾病-药物关联分析
Resume / About
Albert Hsi
医学信息学在读博士。致力于通过组学大数据研究，深入发掘疾病机制与药物靶点，为实际临床决策提供有力支持。
Profile
个人概述
我具有医学、信息学与计算科学的复合交叉背景，长期专注于健康医疗大数据与多组学数据挖掘。致力于连接上游公共数据与下游临床表型，构建可靠的生信分析流程，推动疾病机制研究与转化医学的发展。
- 具备医学、信息学和计算科学的交叉学科背景。
- 拥有扎实的科研项目设计能力与国家级项目技术路线图设计经验。
- 精通高通量组学数据分析流程的搭建与自动化调度。
- 熟练应对高性能计算集群及大型服务器环境的管理与运维实战。
- 具备从上游数据挖掘到下游机制探讨的完整科研数据链条经验。
Education
教育背景
2023.09 – 2027.06
博士研究生 · 医学信息学
山西医科大学
持续深入医学信息学领域，探索计算方法在实际临床中的应用。
2017.09 – 2019.06
硕士 · 临床生物信息学
山西医科大学
英语水平 CET-6；学院研究生第二党支部支部书记；获2017–2018年"院优秀共产党员"称号。
2012.09 – 2016.06
本科 (管理学学士) · 信息系统与信息管理（医药方向）
山西医科大学
校学生会网络部部长；持有山西省大学生创业证书（SIYB）。
Experience
科研工作经历
2019.07 – 2023.02
助理研究员（生信分析工程师）
山西高等创新研究院
负责课题组项目生物信息数据分析；开发与搭建高通量测序流程（RNA-seq, ChIP-seq, RIP/CLIP-seq, MeRIP-seq 等，通过 Shell 和 Snakemake 进行流程控制）；负责浪潮天梭等大数据分析服务器（18核，288线程，TB级内存）的日常运维与管理。
2016 – 至今
健康医疗大数据团队成员
教育部数据中国百校工程曙光大数据应用创新中心
参与组学数据挖掘的疾病-药物关联平台建设；负责公共数据的获取、清洗及多维度分析；全面负责国家自然科学基金项目的技术路线图设计与技术支持。
Publications
发表文章
2022
1. COR regulates the integrity of lysosomal membrane by hnRNP K-stabilized LAPTM5 transcript and promotes cell survival
Yang X, Wen Y, Liu S, Duan L, Liu T, Tong Z, Wang Z, Xi Y, et al.
Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS), 119(5): e2110482119 | IF: 12.78
2022
2. Tumor Cell-Intrinsic BTLA Receptor Inhibits the Proliferation of Tumor Cells via ERK1/2
Cheng T, Liu Y, Yan H, Xi Y, Gao S.
Cancers, 11(24):4021 | IF: 7.67
Awards & Patents
奖项与专利
2025.12.21
广州国家实验室第三届Bio-OS AI开源大赛
一等奖
开源赛事
已授权
计算机软件著作权
3 项
知识产权
Core Skills
核心能力
编程与流程化计算
- Python / R / Shell
- 基于 Snakemake 的流程控制
- 自动化数据清洗与批处理分析
高性能计算平台
- Linux 系统环境与 HPC 集群
- 大数据分析服务器运维与管理
- 高达 288 线程、TB 级内存环境的实战调度
Stack
技术栈
PythonRShellLinuxSnakemakeHPC 集群Bulk RNA-seqscRNA-seq
Domains
研究领域
医学信息学临床生物信息学健康医疗大数据多组学整合挖掘疾病机制研究肿瘤免疫血液系统疾病AI for Biomedicine
Selected Notes
