组学数据分析
- Bulk RNA-seq / 单细胞多组学
- ChIP-seq / RIP/CLIP-seq / MeRIP-seq
- 公共数据库挖掘与疾病—药物关联分析
Resume / About
XYBioinfo
Medical AI Agent Virtual Cell Scientific Workflow
Profile
个人概述
我关注医学信息学、生物信息学与 AI 的交叉实践，希望通过组学大数据研究为医疗决策提供可靠支持。我的工作从公共数据获取与清洗、高通量测序分析流程，延伸到临床研究数据治理、科研工具开发和 AI 原型验证；相比单一模型指标，我更重视问题定义、数据质量、可复现流程与实际交付。
Domains
研究方向
Core Skills
核心能力
Stack
技术栈
Education
教育背景
2023.09 2027.06
医学信息学
山西医科大学 · 中国人民解放军总医院
在山西医科大学攻读博士学位，并在中国人民解放军总医院开展导师组学习与科研工作。
2017.09 2019.06
医学图书情报学
山西医科大学
系统学习医学信息组织、检索与研究方法，英语水平 CET-6。
2012.09 2016.06
信息系统与信息管理（医药方向）
山西医科大学
形成医学信息、数据管理与软件实践的交叉基础。
Experience
工作经历
2019.07 2023.02
生信分析工程师 · 助理研究员
山西高等创新研究院
承担科研项目的生物信息数据分析，开发 RNA-seq、ChIP-seq、RIP/CLIP-seq、MeRIP-seq 等高通量测序流程，并以 Shell、Snakemake 组织可复现计算任务；同时参与大数据分析服务器的日常运维。
2016.09 至今
健康医疗大数据团队成员
教育部数据中国百校工程曙光大数据应用创新中心
参与组学数据挖掘与疾病—药物关联研究，承担公共数据获取、清洗、分析及科研项目技术路线支持。
Research Projects
科研项目
基于 PMF 扰动图谱的 AI 虚拟细胞建模及药物预测
山西省研究生学术创新项目 · 项目负责人
围绕单细胞多组学扰动图谱、虚拟细胞模型、关键分子靶点与候选药物预测开展研究。
第三届 Bio-OS AI 开源大赛：密码子优化项目
Lu.Lab 团队队长 · 一等奖
组织密码子优化算法、严格校验、规则优化与工程化交付。
MPN 临床数据与研究平台合作实践
合作项目 · 进行中
参与骨髓增殖性肿瘤研究的数据治理、数据库规划与研究平台路线设计。
多源药物扰动数据探索平台 DPMEr
软件著作 · 共同著作权人
将药物扰动数据整合与探索思路推进为可说明、可审查、可持续迭代的软件项目。
Publications
发表文章
Integrative miRNA–mRNA Network and Molecular Dynamics-Based Identification of Therapeutic Candidates for Paroxysmal Nocturnal Hemoglobinuria
Pharmaceuticals
Integrated analysis of transcriptome and proteome reveal that PDCoV infection induces autophagy-dependent ferroptosis to facilitate viral replication
Veterinary Research
DeepSeek R1 excels in diagnosing previously misdiagnosed cases
Array
Epitranscriptic regulation of HRAS by N6-methyladenosine drives tumor progression
Proceedings of the National Academy of Sciences
Tumor Cell-Intrinsic BTLA Receptor Inhibits the Proliferation of Tumor Cells via ERK1/2
Cells
LCDR regulates the integrity of lysosomal membrane by hnRNP K–stabilized LAPTM5 transcript and promotes cell survival
Proceedings of the National Academy of Sciences
Practice
实践成果
Live
实况
