目录
目录
项目背景
该课题为山西省青年基金项目,聚焦于细胞自噬(Autophagy)过程在驱动或抑制前列腺癌(Prostate Cancer)发生与发展中的具体作用机制。
主要职责
- 数据库挖掘流程构建:系统整合多源公共组学数据,构建了一套专门针对细胞自噬相关基因(ARGs)的挖掘流程。
- 蛋白互作网络(PPI)构建:基于挖掘到的核心基因,构建了高置信度的蛋白-蛋白相互作用网络,识别了自噬调控的关键 Hub 基因。
- 通路与临床关联分析:开展前列腺相关经典分子通路(如 AR 信号通路等)与自噬网络的关联研究,揭示了潜在的致病与干预机制。
技术栈与方法
- 编程与分析:R, Python
- 数据来源:TCGA, GEO 等大型公共医学数据库
- 核心算法:PPI 网络分析、富集分析、生存分析