主要农作物抗逆优质种质资源创新与发掘

项目背景

该项目为山西省重点研发计划，重点针对“名优”谷子品种与“帽干”小麦品种进行全基因组范围的种质资源挖掘与分子标记开发，以支持抗逆及优质农作物新品种的培育。

主要职责

在本项目中，我主要负责核心的生物信息学分析工作及自动化流程的搭建，包含：

• WGS 分析流程构建：针对“名优”谷子品种，独立搭建并优化了全基因组重测序（Whole Genome Sequencing, WGS）分析流程，涵盖质量控制、比对、变异检测与功能注释。
• miRNA 分析与表型关联：围绕“帽干”小麦品种构建了 miRNA 测序数据分析流程，并主导相关表型基因型鉴定体系的构建，为后续分子机制研究提供数据支撑。

技术栈与方法

• 编程与工具：Linux, Shell, Python, R, Snakemake
• 数据类型：Whole Genome Sequencing (WGS), miRNA-seq
• 高性能计算：基于 HPC 集群完成海量测序数据的批处理与并行计算。